ESTUDIO COMPARATIVO DE LOS SEROGRUPOS DE ESCHERICHIA COLI OBTENIDOS DE MUESTRAS FECALES Y ORINA CON PROPIEDADES DE VIRULENCIA DE LA CLONA O25:H4 ST131

Abstract

Introducción. Escherichia coli (E. coli) es una bacteria Gram negativa, anaerobia facultativa, lactosa positiva y miembro de la familia Enterobacteriaceae. La enterobacteria se ha clasificado en E. coli intra y extraintestinal (ExPEC) siendo esta ultima la causante de infecciones en el tracto urinario (ITU), sepsis y meningitis. La clona O25:H4-ST131 (Sequence type) de E. coli presenta distribución mundial, fue descrita por primera vez en 2008 en base a las secuencias de siete genes housekeeping, es la principal causante de ITU, pero también se ha identificado en heces de pacientes sintomáticos y asintomáticos. Objetivos. Empleando las propiedades fenotípicas y moleculares, se realizó un estudio comparativo de cepas de E. coli aisladas de muestras fecales y del tracto urinario para determinar si pertenecen a la clona O25:H4-ST31. Material y Métodos. Cultivos de E. coli aislados de muestras fecales y orina de niños menores de 5 años fueron identificados con pruebas bioquímicas estándar preparadas en el laboratorio. Se realizó la serotipificación de los cultivos utilizando 188 sueros anti-O y 56 sueros anti-H del esquema antigénico de E. coli (SERUNAM) obtenidos en conejo. Mediante la PCR se determinó la presencia de genes del grupo de E. coli uropatógena (UPEC): fimH, cnf1, hlyA, sat y cdt. Empleando la misma metodología se establecieron grupos filogenéticos de Clermont (yjaA, arpA, trpA y TspE4.C2), además se determinó la presencia de los genes O25b-ST131 y O16-ST131 de la clona de ST131. Los patrones de resistencia a los antimicrobianos se determinaron utilizando el método de Kirby-Bauer con 14 antimicrobianos. Resultados: El análisis de la serotipificación mostró la identificación de los serotipos O25:H4, O15:H5, O25:H-, O16:H-, principalmente. Los resultados de genes de virulencia mostraron que los cultivos albergaban los genes cnf1 (45.5 %), hlyA (40.9 %) sat (87.5%) y cdt (12.5 %), los genes pabB y trpA, identificaron que 22 cepas (44 %) pertenecían a la clona O25b-ST131 y 8 cepas (16 %) a O16-ST131. El grupo filogenético B2 fue el predominante (77.78 %) en cultivos de orina y en heces con mayor frecuencia el grupo A (43.48 %). Las pruebas de sensibilidad mostraron cepas fecales resistentes a cefotaxima (75 %), y cepas del tracto urinario resistentes a ácido nalidíxico (63.64 %), tetraciclina (54.55 %) y trimetoprima/sulfametoxazol (40.91 %). Ambos tipos de aislamientos exhibieron resistencia a ampicilina. La resistencia a ácido nalidíxico se vinculó a la presencia de fimH y sat, mientras que los genes hlyA y cnf1 se vincularon a resistencia a trimetoprima/sulfametoxazol, en tanto sat solo asoció a resistencia a cefotaxima. Conclusión, los datos obtenidos brindan información sobre la prevalencia de la clona ST131 en pacientes pediátricos con diagnóstico de ITU e infecciones gastrointestinales, esto es un indicio de que las cepas de origen fecal son fuente importante de cepas relacionadas con ITUs. Además de proporcionar datos sobre los factores de virulencia que les confieren una mayor patogenicidad y virulencia a las cepas aisladas de orina, así como su resistencia a los antibióticos.