CARACTERIZACIÓN MOLECULAR DE COLECTAS DE AGUACATE DE LA ZONA SUR DEL ESTADO DE MÉXICO.

Abstract

Debido a que la caracterización morfológica es un proceso lento y no tan preciso al existir factores ambientales que pueden alterar la forma de los genotipos de interés, la caracterización molecular es una alternativa que nos permite obtener una mejor descripción del genotipo al basarse en el ADN de las plantas ya que esta no cambia por el ambiente o etapa fenológica. El presente estudio consistió en analizar molecularmente 36 genotipos del género Persea los cuales fueron colectados de algunos municipios de la zona sur del Estado de México, dichos genotipos fueron seleccionados ya que eran sobresalientes a diferentes caracteres como pubescencia de la hoja, tamaño de fruto, calidad comestible y grosor de la cáscara que permitieron considerarlos como colectas de interés. El trabajo operativo consistió de la colecta del material, maceración, extracción del ADN, lavado, cortado, amplificación en PCR y electroforesis utilizando geles de acrilamida con el uso de marcadores RAPD (8) e ISRR (6). Mediante los perfiles de bandas generados se elaboró una matriz básica de datos para cada marcador y se generaron dendogramas mediante diferentes combinaciones con los métodos de Nei and Li / Dice y Neighbor – joining, Jaccard y UPGMA, Jaccard y Neighbor-joining. Se realizó un remuestreo de 1000 repeticiones en el programa Free Tree y se visualizaron en el programa Tree View. Se seleccionaron dos dendogramas, los que mostraban mayor congruencia entre sus agrupamientos; uno mediante RAPD, otro mediante ISSR y un tercero combinando ambos. Se sabe que los RAPD, generan agrupamientos aleatorios entre genotipos basándose en similitudes (variabilidad), mientras que mediante ISSR se identifican fragmentos más específicos del genoma, siendo estos últimos más útiles para encontrar diferencias entre especies (diversidad). Mediante los dendogramas seleccionados se discutieron las probables relaciones entre los genotipos desde el punto de vista de la variabilidad y diversidad que prevalece en la región sur del Estado de México, su similitud, y se infiere sobre la presencia de probables especies en la región.