Identificación y caracterización de actinobacterias con presencia de los sistemas PKS y NRPS

Abstract

Uno de los pasos más importantes en el proceso de obtención de nuevos metabolitos secundarios, a partir de productos naturales de origen microbiano es la selección de bacterias adecuadas, como las actinobacterias. Este phylum se caracteriza por su capacidad para producir diferentes compuetsos bioactivos, los cuales se sabe que son producidos por los sistemas modulares policétido sintasa (PKS) y el sintetasa de péptido no ribosomal (NRPS). Con el objetivo de explorar la presencia y distribución de estos sistemas biosintéticos en actinobacterias, se han diseñado iniciadores específicos para las regiones del sistema PKS y NRPS, permitiedo una rápida detección de dichos sistemas en actinibacterias. En este estudio se identificaron actinobacterias halófilas y haloalcalófilas con la presencia de los sistemas PKS y NRPS para predecir la síntesis de móleculas bioactivas. Se aislaron e identificaron 51 cepas de actinobacterias halófilas y haloalcalófilas, provenientes de ambientes salinos y salino-sódicos de México. El análisis filogenético basado en la secuenciación del gen 16S rRNA mostró que las cepas aisladas pertenecen a los géneros Saccharomonospora, Actinopolyspora y Nocardiopsis. El sistema PKS fue detectado en 5 cepas del genero Saccharomonospora. El sistema NRPS fue detectado en 6 cepas pertenecientes a los géneros Nocardiopsis y Saccharomonospora. La presencia de ambos sistemas PKS y NRPS fue detectada en 37 cepas correspondientes a los tres géneros identificados. Tres cepas no demostraron la presencia de los sistemas PKS y NRPS. La determinación de la presencia de regiones génicas especificas permitirá identificar si una cepa de actinobacteria es potencialmente productora de compuestos con posible aplicación en biomedicina.