Mostrar el registro sencillo del objeto digital
dc.contributor | Vázquez Chagoyán, Juan Carlos | |
dc.contributor.author | Sánchez Bermudez, Juan Carlos | |
dc.date.accessioned | 2018-02-08T19:09:01Z | |
dc.date.available | 2018-02-08T19:09:01Z | |
dc.date.issued | 2017-08-23 | |
dc.identifier.uri | http://hdl.handle.net/20.500.11799/68472 | |
dc.description | Se extrajo material genético (RNA) exitosamente de 20 muestras de garraparatas, sin embargo sólo se amplificaron 11, por razones de costos. Se purificaron los productos de PCR, se observaron de manera cualitativa por medio de un gel de agarosa y se midieron las relaciones de longitudes de onda. Aunque se encontraron pequeñas contaminaciones de residuos de isotiocianato de guanidina, la secuenciación fue adecuada. Se obtuvieron 88 secuencias que se ensamblaron en el software Codoncode Aligner (CodonCode Corporation, www.codoncode.com), para obtener finalmente 11 secuencias. Con el software MegAlign (DNAStar) se determinaron las respectivas secuencias aminoacídicas y también se obtuvieron las matrices de similitud , identidad y divergencia. Los porcentajes obtenidos nos describen que las secuencias son más parecidas entre ellas que con respecto a la secuencia vacunal (M29321). Estas secuencias tuvieron una variación de 5.7, igual a lo reportado por García-García et al., lo que indica que la vacuna comercial usada contra las muestras de garrapatas tendría poca eficacia contra las poblaciones representadas por la muestra tomada en el estado Tabasco. De igual forma las secuencias obtenidas fueron más parecidas a las de Texas que a las de Tailandia y se confirma gráficamente en el árbol filogenético, en las que se incluyeron en un cluster junto a otras cepas de América. Se predijeron epítopes con 3 softwares, los cuales corroboraron péptidos que previamente mostraron actividad antigénica. Aunque existieron sustituciones aminoacídicas entre los epítopos predichos y las secuencias, no podemos determinar si estos afectan en la antigenicidad in vivo, para tal motivo sería necesario sintetizar cada uno de los péptidos y comparar la actividad antigénica que causan. | es |
dc.description.abstract | Las garrapatas son artrópodos con un complejo ciclo de vida, actualmente se reconocen tres familias Ixodidae, Argasidae y Nuttalliellidae. Dentro de Ixodidae se ubica el género Rhipicephalus que incluye a la especie Rhipicephalus microplus. Esta garrapata tiene una amplia distribución en el mundo que, lamentablemente, genera múltiples pérdidas económicas por su impacto en la productividad en ganado bovino (carne y leche) y la transmisión de dos enfermedades importantes para la producción de ganado: anaplasmosis y babesiosis. En distintas partes del mundo se han buscado métodos para su control, siendo el más común el uso de acaricidas, pero el ectoparásito ha desarrollado resistencia a ellos, por lo que se han examinado otras alternativas. Una de ellas es el uso de una vacuna. TickGARD y Gavac fueron creadas en Australia y Cuba respectivamente, a partir del antígeno bm86, que se aisló de células epiteliales del intestino de la garrapata, esta ha tenido poca eficacia en México y otros países, probablemente debido a las variantes en el gen. En el estado de Tabasco se han encontrado varios casos de múltiple resistencia a acaricidas, por lo que el uso de esta vacuna sería prometedor. Sin embargo, no se conocen los genotipos de bm86 del estado, su conocimiento ayudaría a predecir la eficacia de la vacuna. En este trabajo se secuenció el gen bm86 de 11 ejemplares de garrapatas Rhipicephalus microplus colectadas de una población del estado de Tabasco y se determinó que el porcentaje de variación con respecto a M29321 es de 3.4%. Estas secuencias se ubicaron más cercanas genéticamente a las reportadas de Texas que a las de Tailandia. También se predijeron epítopos in silico y se propusieron 6 como candidatos vacunales. | es |
dc.language.iso | spa | es |
dc.publisher | Universidad Autónoma del Estado de México | es |
dc.rights | openAccess | es |
dc.rights | https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/ | es |
dc.rights | openAccess | es |
dc.rights | https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/ | es |
dc.subject | GEN bm86 | es |
dc.subject | Ganado Bovino | es |
dc.subject | Epítopes | es |
dc.subject | Análisis filogenético molecular | es |
dc.subject | Agentes químicos | es |
dc.title | Análisis de la Variación del GEN bm86 de una Población de Rhipicephalus microplus de ganado bovino del ESTADO DE TABASCO, MÉXICO | es |
dc.type | Tesis de Licenciatura | es |
dc.provenance | Académica | es |
dc.road | Dorada | es |
dc.organismo | Ciencias | es |
dc.ambito | Internacional | es |
dc.cve.CenCos | 21901 | es |
dc.modalidad | Tesis | es |