Resumen:
Rhipicephalus microplus (antes conocida como Boophilus microplus), ha sido combatida por más de 60 años en nuestro país mediante la aplicación de tratamientos garrapaticidas sobre el cuerpo de los bovinos, sin embargo, la aparición de garrapatas resistentes y multirresistentes a los distintos químicos es un problema creciente. Un Método alternativo para combatir a la garrapata es el inmunológico, tal es el caso de una vacuna comercial basado en antígeno del intestino medio de la garrapata denominado como Bm86. Esta vacuna ha sido probada en campo con un éxito aceptable. Sin embargo, variaciones en la secuencia de aminoácidos mayores al 3% en comparación con el antígeno vacunal, parecen afectar la efectividad de la misma. La que efectividad de esta vacuna parece estar sujeta a la prevalencia de los diferentes genotipos de Bm86 en las distintas regiones geográficas del mundo. No se conoce la variabilidad del gen Bm86 en México, tampoco se ha hecho un estudio sobre como estas variantes impactan en la antigenicidad de la molécula. Conocer dicha información, podría ayudar a proponer candidatos vacunales más específicos. En el presente trabajo aislamos y secuenciamos el gen Bm86 de ejemplares de R. microplus provenientes de 10 localidades distintas del país, las secuencias obtenidas fueron sometidas a análisis moleculares para identificar los haplotipos circulantes en México. Se encontraron un total de 64 haplotipos en un total de 125 secuencias mexicanas. Los promedios de identidad para dicha secuencia se mantuvieron entre 99 y 98.5% en sus cadenas de nucleótidos y aminoácidos respectivamente. Los porcentajes de divergencia en la cadena de aminoacidos entre la cepa vacunal de referencia Yeerongpilly y nuestros aislados, oscilo entre 3 y 7.4%, en tanto que, la comparación con secuencias reportadas para otras partes del mundo, los valores más bajos de divergencia con nuestras secuencias se observaron en los reportes texanos (1-2.2%). Adicionalmente, en este trabajo, desarrollamos un modelo de la teoría de las perturbaciones capaz predecir la propensión de un péptido de ser más, o menos antigénico después de una perturbación. Dicho modelo fue capaz de clasificar más de 26,112 casos de perturbaciones en péptidos provenientes de 14 secuencias del estado de Colima, México. Posteriormente, el modelo se aplicó a las 125 secuencias mexicanas. El modelo tiene una sensibilidad del 71% y especificidad del 80% para las series de entrenamiento y validación respectivamente. Con este modelo se predijo el impacto en la inmunogenicidad de cada péptido debido a la variación de dichas secuencias, lo que nos permitió proponer 3 secuencias consenso que reúnen toda la información de los epítopos lineales para células B como los candidatos vacunales más específicos para México.